CEPAD - centro de processamento de alto desempenho do ICB/UFMG
Laboratório lmbioinfo do Centro de Laboratórios Multiusuários - CELAMEquipe | Equipamentos | Cadastro | Normas | Comandos | Contato | Software | Produção
Equipe | Equipamentos | Cadastro | Normas | Comandos | Contato | Software | Produção
| Sistema multiusuário e como acessar | Servidor de aplicações web: BIOINFO | Computação de alto desempenho: SAGARANA | Servidor LDAP: SARAPALHA |
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O sistema computacional
instalado no CEPAD foi adquirido
por meio de dois projetos Capes
Equipamentos Multiusuários, de 517 e 247 mil reais, e
visa impulsionar as pesquisas e
especialmente os programas de
pós-graduação do ICB. O acesso
ao sistema pode ser requisitado
por e-mail para CEPAD (ver link abaixo). Estudantes de
Iniciação Científica registrados
em algum programa de pós-graduação do instituto também
podem se cadastrar para uso.
Pesquisadores colaboradores
devem estar cadastrados como colaboradores junto aos
programas de pós-graduação.
Com isso, a identidade do usuário
é bem verificada.
Empresas interessadas no uso do equipamento ou na contratação de processos devem contactar o CENEX/ICB para informações e redirecionamento, já que os serviços são ofertados como Extensão, ou diretamente o CEPAD: cepad@icb.ufmg.br. O custo do uso de uma máquina com 64 cores e 512 Gb de memória é de 9,5 reais/hora. Procuramos interessados em hospedar processos de análise em nosso serviço de extensão, entrem em contato. |
O servidor BIOINFO é dedicado a ofertar aplicações desenvolvidas no Instituto, seja por acesso web, seja por interface programática para aplicações (API), via web (os web services).
O servidor BIOINFO é uma máquina virtual que conta com 32 núcleos, 48 Gb de memória e 3 Tb de armazenamento. Ela contém um servidor r-studio. É a máquina utilizada para aulas práticas de bioinformática para a graduação, dentre outras disciplinas. Interessados em hospedar suas aplicações wed por favor escrevam para cepad@icb.ufmg.br. |
O "cluster" computacional SAGARANA é dedicado à computação de alto desempenho. Para acessar o "cluster" SAGARANA o usuário deve seguir as recomendações distribuídas por contato com cepad@icb.ufmg.br e contidas aqui. Ele é composto por: a) um nó de controle com 24 núcleos, 64 Gb de memória e um sistema RAID5 de 5 Tb. O acesso de usuários e o controlador de filas (OpenPBS) ficam nesta unidade. b) quatro nós de processamento com 64 núcleos, 512 Gb de memória e um sistema RAID0 local de 730 Gb (montado em /tmp), para ser usado em caso de muitas chamadas I/O. c) um nó de processamento de alto desempenho com 256 núcleos virtuais e 2048 Gb de memória e que tem acesso a um sistema de armazenamento exclusivo ao nó em RAID6 com 55 Tb (montado em /tmp). d) um nó de armazenamento de 148 Tb em RAID6, que exporta o sistema de arquivos para toda a SAGARANA. O diretório /home dos usuários é hospedado nesse nó e não há limite de uso. O diretório /programs hospeda os programas e o /databases, as bases de dados mais usadas. A SAGARANA tem um gerenciador de fila OpenPBS com apenas duas filas físicas, uma para utilizar as quatro máquinas de 64 cores, e outra para utilizar a máquina de 256 cores. O usuário opera como se estivesse utilizando um servidor em seu laboratório, de forma transparente (instruções abaixo) |
O servidor SARAPALHA tem o servidor LDAP e é dedicado à transferência de arquivos. O servidor SARAPALHA é também uma máquina virtual com 8 núcleos, 8 Gb de memória e um sistema RAID10 de 7 Tb que hospeda as pastas 2sagarana para troca de dados com/de sagarana. A SARAPALHA se conecta diretamente a uma porta da SAGARANA para espelhamento da pasta 2sagarana, assim uma vez feito download para a pasta 2sagarana da SARAPALHA os dados são transferidos para a SAGARANA. Esta última, por meio de uma porta de 10 Gbps se conecta com o nó de 256 cores e seu HD de 55 Tb, garantindo upload rápido de leituras de sequenciamento para montagem de genomas. A SARAPALHA possui um banco de dados MariaDB que pode ser acessado pelo sistema. |
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